O Bach-Archiv foi fundado por ocasião do bicentenário da morte de Bach em 1950 por Werner Neumann , que permaneceu como seu diretor até 1973. Serviu como um arquivo central para manuscritos e documentos históricos ligados ao compositor e um centro central de pesquisa relacionado ao ele e sua família.
Na época da fundação da instituição, Leipzig ficava na Alemanha Oriental . Antes da unificação alemã, houve colaboração com especialistas de Bach na Alemanha Ocidental . Por exemplo, a segunda edição das obras completas de Bach, o Neue Bach-Ausgabe , foi um projeto conjunto entre o Bach-Archiv e o Johann-Sebastian-Bach-Institut em Göttingen , Alemanha Ocidental. [1] Após a unificação, o Bach-Archiv tornou-se parte da Konferenz Nationaler Kultureinrichtungen, uma união de mais de vinte organizações culturais na antiga Alemanha Oriental que são consideradas nacionalmente significativas. O Göttingen Institute foi fechado em 2006. Desde 23 de novembro de 2008, o Bach-Archiv é um instituto da Universidade de Leipzig.